Kaip apskaičiuojamas derinimo balas?
Kaip apskaičiuojamas derinimo balas?

Video: Kaip apskaičiuojamas derinimo balas?

Video: Kaip apskaičiuojamas derinimo balas?
Video: Dešimtokų rezultatus išvydęs viceministras: tokios mokyklos neturi ateities 2024, Lapkritis
Anonim

The balas iš an lygiavimas , S, apskaičiuotas kaip pakeitimo ir tarpo suma balai . Pakeitimas balai pateikiami paieškos lentelėje (žr. PAM, BLOSUM). Tarpas balai paprastai yra apskaičiuotas kaip G, tarpo atidarymo baudos ir L, tarpo padidinimo baudos, suma. Jei tarpas yra n ilgio, tarpo kaina būtų G+Ln.

Taigi, kas yra derinimo balas?

Optimalus lygiavimas ir derinimo balas Optimalus lygiavimas yra lygiavimas suteikiant aukščiausią balas , ir derinimo balas yra tai aukščiausia balas . Tai yra derinimo balas iš X ir Y = balas X ir Y esant optimaliam lygiavimas . Pavyzdžiui, derinimo balas iš šių X ir Y yra 36.

Be to, kaip veikia sekos derinimas? Bioinformatikoje a sekos derinimas yra būdas sutvarkyti sekos DNR, RNR arba baltymo, siekiant nustatyti panašumo sritis, kurios gali būti funkcinių, struktūrinių ar evoliucinių ryšių tarp sekos.

Taigi, kas yra bioinformatikos balas?

Sekos derinimo kontekste a balas yra skaitinė reikšmė, nusakanti bendrą lygiavimo kokybę. Didesni skaičiai atitinka didesnį panašumą. The balas mastas priklauso nuo taškais naudojama sistema (pakeitimo matrica, tarpo bauda).

Kas yra optimalus sekos derinimas?

The optimalus derinimas iš dviejų baltymų sekos yra lygiavimas tai maksimaliai padidina porų balų sumą, atėmus bet kokią baudą už įvestas spragas. Dinaminis programavimas leidžia optimalus derinimas iš dviejų sekos rasti mn žingsnių eilės tvarka, kur m ir n yra ilgiai sekos.

Rekomenduojamas: