Video: Kaip kontigai surenkami į pastolius?
2024 Autorius: Miles Stephen | [email protected]. Paskutinį kartą keistas: 2023-12-15 23:38
Kuriant genomo juodraštį pirmiausia nuskaitoma individuali DNR surinkti į kontigus , kurie pagal savo pobūdį surinkimas , tarp jų yra tarpų. Kitas žingsnis yra į tada užpildykite tarpus tarp jų priklauso nuo sukurti pastoliai . Tai galima padaryti naudojant optinį atvaizdavimą arba poros seką.
Panašiai galite paklausti, kas yra kontigai ir pastoliai?
A pastoliai yra genomo sekos dalis, atkurta iš galutinės sekos viso genomo šautuvų klonų. Pastoliai yra sudaryti iš kontigų ir spragas. A contig yra gretimas genominės sekos ilgis, kuriame bazių tvarka žinoma iki didelio patikimumo lygio. Kai kuriais atvejais, pastoliai gali sutapti.
Be to, kas yra kontigs bioinformatikoje? A contig (iš gretimų) yra persidengiančių DNR segmentų rinkinys, kuris kartu sudaro konsensuso DNR sritį. Contigs Taigi, priklausomai nuo konteksto, gali reikšti ir persidengiančią DNR seką, ir sutampančius fizinius segmentus (fragmentus), esančius klonuose.
Šiuo atžvilgiu kaip surenkami kontigai?
DNR fragmentų sutampančios DNR sekos rinkinys žinomas kaip a contig . Contig kartografavimas yra procesas, kurio metu klonai persidengia surinkti kad sutaptų seka. Tai apima sutvarkymą kontigų tvarka ir orientacija. Klonuoti kontigai gali būti automatiškai surinkti naudojant jų BAC pabaigos sekas.
Kodėl kontigai yra svarbūs?
Contig surinkimas yra an svarbu genomo surinkimo žingsnis. Atvaizdavimui sutampantys klonai surenkami taip, kad seka persidengia. Kiekvienas fragmentas klonuojamas vektoriuje ir sekvenuojamas iš abiejų galų, kad būtų gauta maždaug 600–700 bp sekos ilgis. Abiejų DNR fragmento galų seka vadinama poriniu galu.
Rekomenduojamas:
Kaip manote, kaip atrodys DNR?
DNR atrodys kaip balta, drumsta arba smulki styginė medžiaga. DNR plika akimi nematoma kaip viena grandinė, bet kai yra tūkstančiai DNR gijų, galėsite matyti dideles DNR gijų grupes
Kodėl vandens pelėsiai apibūdinami kaip grybeliai kaip protistai?
Antroji į grybus panašių protistų grupė yra vandens pelėsiai. Vandens pelėsiai yra siūliniai protistai, o tai reiškia, kad jų ląstelės sudaro ilgas, į sruogas panašias struktūras. Šios gijos atrodo panašios į tam tikrų grybų augimą, taip pat gali sudaryti sporas kaip grybai. Taigi, vėlgi, tai paaiškina pelėsinę pavadinimo dalį
Ar energiją gaminanti biocheminė reakcija, kurioje organinės molekulės tarnauja ir kaip elektronų akceptoriai, ir kaip donorai?
Apibrėžkite fermentaciją. Energiją gaminančios biocheminės reakcijos, kurių metu organinės molekulės tarnauja ir kaip elektronų akceptorius, ir kaip donoras, vykstančios anaerobinėmis sąlygomis
Kaip rašyti 13/4 kaip mišrų skaičių?
Kaip neigiama netinkama trupmena (|skaitiklis| > |vardiklis|): - 13/4 = - 13/4 Kaip mišrus skaičius. (sveikas skaičius ir tinkama trupmena, to paties ženklo): - 13/4 = - 3 1/4 Procentais: - 13/4 = - 325 %
Kaip vadinami medžiai, kurie atrodo kaip skėčiai?
Holly ąžuolas (Quercus ilex) ir beždžionių dėlionės medis (Araucaria araucana) yra aukšti, visžaliai medžiai su skėčio formos lajais iš Viduržemio jūros klimato ir auga USDA zonose nuo 7 iki 10. Holly ąžuolas dažnai pasižymi ryškia skėčio forma, bet kartais turi ryškią skėčio formą. suapvalintas stogelis