Kuo skiriasi 16s rRNR ir 18s RRNR?
Kuo skiriasi 16s rRNR ir 18s RRNR?

Video: Kuo skiriasi 16s rRNR ir 18s RRNR?

Video: Kuo skiriasi 16s rRNR ir 18s RRNR?
Video: Димитар Сасселов: Как мы обнаружили сотни планет подобных Земле 2024, Gegužė
Anonim

Pagrindinis skirtumas tarp atliekant analizes su 18S rRNR vietoj genų duomenų 16S rRNR genų duomenys (arba ITS duomenys) yra etaloninė duomenų bazė, naudojama OTU rinkimui, taksonominėms priskyrimams ir šablonais pagrįstam derinimo kūrimui, nes joje turi būti eukariotų sekos.

Atsižvelgiant į tai, kodėl identifikavimui naudojamas 16s rRNR genas?

The 16S ribosomų RNR genas koduoja bakterinės ribosomos 30S subvieneto RNR komponentą. Dėl DNR ir DNR hibridizacijos sudėtingumo, 16S rRNR genas seka yra naudojamas kaip įrankis nustatyti bakterijų rūšių lygiu ir padeda atskirti glaudžiai susijusias bakterijų rūšis [8].

Be to, ar eukariotai turi 16s rRNR? The 16S rRNR genas yra visose bakterijose, o susijusi forma yra visose ląstelėse, įskaitant ir eukariotų.

Taip pat kyla klausimas, kas yra 18s ir 28s rRNR?

The 28S / 18S ribosomų RNR santykis dažnai naudojamas vertinant visos RNR, išgrynintos iš bet kurio mėginio, kokybę. Žmonėms, 28S rRNR turi ~5070 nukleotidų, ir 18S turi 1869 nukleotidus, o tai suteikia a 28S / 18S santykis ~2,7. Aukstas 28S / 18S santykis rodo, kad išgryninta RNR yra nepažeista ir nesuirusi.

Kas yra 16s rRNR sekos nustatymas?

16S rRNR genas seka analizė yra standartinis bakterijų taksonomijos ir identifikavimo metodas, pagrįstas aptikimu seka skirtumai (polimorfizmai) hiperkintamuosiuose regionuose 16S rRNR genas, kuris yra visose bakterijose.

Rekomenduojamas: